1、有機(jī)肥含有有機(jī)物質(zhì)可以提高土壤營養(yǎng)成分，但化肥只供應(yīng)作物無機(jī)營養(yǎng)，其長期應(yīng)用的土壤是不好的。
  
  2、有機(jī)肥含有多種養(yǎng)分平衡和完成，而化肥養(yǎng)分單一，長期使用會(huì)使土壤和食品營養(yǎng)不均衡。
  
  3、有機(jī)肥養(yǎng)分含量低，因此需要大規(guī)模的應(yīng)用，但化肥養(yǎng)分含量高和低的應(yīng)用
  
  4、有機(jī)肥肥效持續(xù)時(shí)間長；化肥肥效短而強(qiáng)，但很容易使養(yǎng)分流失和環(huán)境污染
  
  5、有機(jī)肥來自自然無任何化學(xué)原料，提高農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量；化肥屬于化學(xué)合成物質(zhì)，使用不當(dāng)會(huì)降低產(chǎn)品的質(zhì)量
  
  6、有機(jī)肥處理只需要爛，提高抗旱、抗病、抗蟲能力，減少農(nóng)藥的使用量；化肥減少長時(shí)間使用–植物免疫，它需要大量的化學(xué)農(nóng)藥來維持植物生長，容易增加食品有害物質(zhì)。
  
  7、有機(jī)肥含有大量有益微生物促進(jìn)土壤生物轉(zhuǎn)化處理，以提高土壤肥力的優(yōu)點(diǎn)；但化肥會(huì)抑制土壤微生物的活動(dòng)，導(dǎo)致自動(dòng)調(diào)節(jié)能力下降。